私のかかりつけのレディースクリニックの先生から受けた注意事項は、
「睡眠時間が３時間未満だった日は計らなくて良い」
「計る前に起き上がってしまった日は計らなくて良い」
「計れなかった日の分はグラフをつながない」だけで、
特に計る時刻についての言及はありませんでした。ご参考までに。