戦国時代のよくわからないこと

まず、地侍がいます
ある程度の土地を支配しています
そこに戦国武将がやってきます
で、主従契約を結びます
領地は安堵されます
ってこと？

ところが戦で主が負けます
すると、即勝った方の家来になるのではなくて、自分の領地は持ったまま、フリーになるの？
で、自立するか、どこかにつくか、どこかにつかないうちに攻められて制服されるか
なのか？
どこの場合でも信濃みたいにある程度の自治独立は確保した国衆がいたの？