iPod側ではなくて、そのiPodの同期に使ってるパソコンのiTunesの方で設定できます。
iTunesの「環境設定」の「再生」のところに「曲をクロスフェード」というのがあると思いますが、それにチェックが入ってませんか？入ってたら、それを外せば大丈夫と思います。