社会福祉協議会が寄付額を公表するのは、自らが発行している広報誌（寄付全部を記載するか、一定額以上を実名記載するかは各社会福祉協議会で違います。）と収支報告書の中だけです。
寄付した事を広報誌に載せてもらいたくない場合は、その旨を寄付先の社会福祉協議会に伝えれば匿名扱いになるはずです。
収支報告書は一般の人の目に触れることがありませんから、実名でも大丈夫だと思います。
（個人が情報公開を求めれば別ですが、通常そんな面倒なことはしないのでご安心を）