Windowsでも、タイミングが悪いと同じ目に遭いそうですね。
まれに、サードパーティソフトで、システムアップデート前にアンインストールしておかないと、カーネルパニック確定なやつもあったように記憶しています。TimeMachineとかで無理矢理切り抜けても、不安定の種を残すだけなので、すっきり再インストールが（手間だけど）ベストかも知れません。